Κάθε σύνολο από Εργαλεία Ανάγνωσης αποτελείται από μεμονωμένα εργαλεία (π.χ. Σχετικές μελέτες, Online Forums, κλπ.) με κάθε εργαλείο να αποτελείται από έναν αριθμό από σχετικές βάσεις δεδομένων κατηγοριοποιημένες σε ένα πλαίσιο αναζήτησης. Αυτές οι βάσεις, και τα αντίστοιχα πλαίσια αναζήτησης, μπορούν να δημιουργηθούν, διαμορφωθούν ή διαγραφούν.
Μεταδεδομένα φια τεκμήρια σε ένα πλαίσιο αναζήτησης. Ο Διαχειριστής του περιοδικού μπορεί να αλλάξει τον τίτλο του εργαλείου. Επίσης παρέχεται η επιλογή να καθοριστεί αν οι λέξεις κλειδιά (εξ'ορισμού) του Συγγραφέα, το όνομα του Συγγραφέα (π..χ για χρήση στο Άλλες Εργασίες του Συγγραφέα), ή γεωγραφικοί όροι θα χρησιμοποιηθούν για αναζήτηση στην βάση δεδομένων. ια άλλη επιλογή, που χρησιμοποιείται με τους Όρους αναζήτησης σε λεξικό, επιτρέπουν στον αναγνώστη να επιλέξει τον όρο αναζήτησης πατώντας διπλό κλικ σε κάθε λέξη του κειμένου του τεκμηρίου του περιοδικού. Οι Διαχειριστές του Περιοδικού μπορούν να χρησιμοποιήσουν αυτές τις επιλογές όταν δημιουργούν δικά τους εργαλεία ανάγνωσης .
Επεξεργασία αναζητήσεων για κάθε εργαλείο. Με την επιλογή "Αναζητήσεις", Ο Διαχειριστής του περιοδικού μπορεί να επεξεργαστεί ή να διαγράψει το URL αναζήτησης για κάθε βάση δεδομένων σε ένα εργαλείο, όπως επίσης να αναταξινομήσει τις βάσεις δεδομένων που εμφανίζονται στο εργαλείο. Για κάθε βάση δεδομένων, ορίζεται ένα URL το οποίο επιτρέπει στους αναγνώστες να μάθουν περισσότερα για την βάση, και ένα URL που ενεργοποιεί την αναζήτηση. Υπάρχουν δύο είδη αναζήτησεις που μπορούν να οριστούν, μια αναζήτηση GET, και αν αυτό δεν δουλέψει με την συγκεκριμένη βάση, υποστηρίζεται και μια αναζήτηση POST.
GET αναζητήσεις
Για τις GET αναζητήσεις, διενεργήστε μια αναζήτησης και δείτε το URL του αποτελέσματος. Π.χ. στο Google, μια αναζήτησης για "FOOBAR" δίνει το URL
http://www.google.gr/search?hl=en&q=FOOBAR&meta=
Αντικαταστήστε το όρο αναζήτησης, FOOBAR, με την μεταβλητή {$formKeywords}. Όταν το OJS συναντήσει αυτή την μεταβλητή, θα αντικασταθεί με την κατάλληλη τιμή από τα μεταδεδομένα του τεκμηρίου. Αυτό δίνει ένα URL αναζήτησης του τύπου
http://www.google.ca/search?hl=en&q={$formKeywords}&meta=
για το Εργαλείο Ανάγνωσης. Παρ'όλοα αυτά, καθώς οι υπόλοιπες παράμετροι δεν είναι απαραίτητες σε αυτή τη περίπτωση, μπορούμε να χρησιμοποιήσουμε ένα πιο απλό URL όπως
http://www.google.ca/search?q={$formKeywords}
για το Εργαλείο Ανάγνωσης.
POST αναζητήσεις
Η περίπτωση των POST αναζητήσεων είναι πιο περίπλοκη. Ξανά χρησιμοποιόντας το Google, μπορείτε να δείτε τον κώδικα της σελίδας και να προσέξετε ότι το <form action="/search" ...>, μας δίνει ένα URL βάσης για την έναρξη της αναζήτησης http://www.google.com/search. Μετά μπορείτε να δείτε κάθε <input ...> και <select ... > στοιχείο της φόρμας, και να τα προσθέσετε ως name=value ζεύγη χωρισμένα από & μέχρι το τέλος του URL. Το στοιχείο που καθορίζει το πεδίο κειμένου που δέχεται το κείμενο προς αναζήτηση από τον χρήστη (στην περίπτωση του Google, το q), θα πρέπει και σε αυτή την περίπτωση να έχει την τιμή {$formKeywords}, που θα αντικαστασταθεί από την κατάλληλη τιμή.
Ένας κάπως πιο απλός τρόος για φόρμες POST είναι να αντιγράψετε τον HTML κώδικα σε ένα αρχείο, να αλλάξετε το method=post σε method=get στο κατάλληλο πεδίο της φόρμας, και να αλλάξετε την τιμή του action= της φόρμας ώστε να είναι ένα ολοκληρωμένο URL, π.χ, http://www.google.com/search από απλά /search. Μετά μπορείτε να δείτε το διορθωμένο αρχείο HTML στον browser σας και να χρησιμοποιήσετε την μέθοδο GET για να δημιουργήσετε το URL.
Καθώς μερικές μηχανές αναζήτησης δεν υποστηρίζουν ερωτήματα GET, αν ανακαλύψετε ότι η παραπάνων μέθοδος δεν δουλεύει, μπορείτε να εισάγετε δεδομένα φόρμας POST στο πεδίο "Search post data" field. Αν το παραπάνω παράδειγμα απαιτεί τα δεδομένα να αποσταλούν (posted), θα πρέπει να εισάγετε http://www.google.com/search για το URL αναζήτησης και q={$formKeywords} για τα post δεδομένα.
Σιγουρευτείτε ότι ελέγξατε τα URLs και ότι δουλεύουν σωστά, αντικαθιστώντας το {$formKeywords} με έναν όρο αναζήτησης στο URL και δείτε αν εμφανίζονται τα προβλεπόμενα αποτελέσματα. Σημειώστε ότι στις POST φόρμες αυτό δεν είναι πάντα δυνατό, ανάλογα με τον ιστότοπο. Για URL που δεν έχουν κανονικές μηχανές αναζήτησης μια άλλη δυνατότητα είναι να χρησιμοποιείσετε το Google με τον περιορισμό για ιστοτόπους. Μπορείτε να χρησιμποιήσετε μια αναζήτηση όπως site:mysite.com FOOBAR στο Google για να αναζητήσετε με τον ότο "FOOBAR" μόνο στον ιστότοπο mysite.com. Η μέθοδος αυτή χρησιμοποιείται στα τρέχονται Εργαλεία Ανάγνωσης για πολλούς ιστοτόπους.